Ein Anastomosenulkus entwickelt sich nach einer Magenresektion oder anderen Eingriffen, wie z. B. einer Gastroenterostomie, bei denen eine Anastomose des Magens mit einem anderen Teil des Magen-Darm-Trakts erfolgt. In solchen Fällen entwickelt sich ein Geschwür in der Nähe des Stomas; es befindet sich fast immer im ableitenden Bereich des Darms, nicht im Magen.